Dopo la sconfitta ad opera dei cinque Gatchaman del misterioso avversario Generalissimo X passano alcuni anni, durante i quali egli medita vendetta; riesce a trasformare un giovane in un essere androgino e facendone così il nuovo leader del suo gruppo terroristico denominato Galactor. Saputo ciò, il dottor Nambu e l'organizzazione internazionale per la scienza chiedono ai Gatchaman di tornare al servizio attivo.