La banda riesce a convincere Jeremy a far testare loro la Skid. Durante questa prova, si presentano alcuni bug nel sistema di navigazione, lasciando il gruppo bloccato nel mare digitale. Jeremy corre nella sua stanza per andare a prendere i programmi di backup, ma dimentica che è la giornata delle prove antincendio e si imbatte in diversi insegnanti, alla fine è costretto a scalare il tetto per raggiungere la sua stanza. Nel frattempo, la Skid s'imbatte in un altro Lyoko e viene attaccata da due mostri simili ad anguille. Jeremy è in grado di riparare il sistema di navigazione e portare i suoi amici a casa, dopodiché ipotizza che la replica di Lyoko sia stata creata da XANA sulla base dei ricordi che aveva rubato ad Aelita nell'ultimo episodio della seconda stagione. Jeremy si chiede come abbia intenzione di usarla.