Tien jaar na de dood van Light Yagami, de oorspronkelijke eigenaar van het 'death notebook', een bovennatuurlijk object waardoor het mogelijk is om mensen te doden door hun naam op de pagina's te schrijven, sluit Tsukuru Mishima zich aan bij een speciale onderzoekseenheid die moorden onderzoekt die mogelijk kunnen worden toegeschreven aan het gebruik van het notitieboekje. Ondertussen besluit Ryūzaki, de aangewezen opvolger van de internationaal gerenommeerde detective Elle, na talloze zaken in het buitenland te hebben behandeld, een reeks moorden te onderzoeken die kunnen worden toegeschreven aan de Death Note. De cyberterrorist Yūki Shien, een volgeling van Kira en gretig om zijn heldendaden te traceren, ontvangt het notitieboekje van de shinigami Ryuk en besluit het te testen op Taichi Kanagawa, schuldig aan het vermoorden van een klein meisje in het verleden.